Основні напрямки роботи лабораторії — це бактеріологічні та мікологічні дослідження. Вони дозволяють виявити збудників інфекційних хвороб людини та визначити їх чутливість до антибіотиків та антимікотиків для призначення ефективного лікування.
Лабораторія мікробіології максимально орієнтована на потреби клієнтів і постійно адаптується до оновлень та інновацій. Для цього лабораторія оснащена обладнанням від найкращих світових виробників: Bruker, Alifax, Becton Dickinson, Biomerieux, Liofilchem, Thermo Fisher Scientific, що забезпечує автоматизоване виконання широкого спектру мікробіолоігчних досліджень.